Sekarang memiliki Edens Zero, Shiki Granbell telah mengumpulkan Empat Bintang Bersinar. Dengan bantuan teman-teman barunya, Shiki akan dapat menembus Dragonfall—batas Cosmos Sakura yang dipenuhi dengan naga mekanik. Begitu dicapai, dia bisa melanjutkan pencariannya untuk menemukan dewi Mother.

Sebelum kru Edens Zero dapat melanjutkan perjalanan mereka, mereka melihat sebuah kapal perang misterius mengikuti mereka. Setelah mengetahui bahwa kapal tersebut—Belial Gore—milik Drakken Joe, Shiki dan krunya mencoba untuk menyusupinya, bermaksud mencari tahu mengapa Dark Alchemist itu mengejar mereka. Dalam prosesnya, Edens Zero diambil sebagai sandera oleh anak buah Drakken.

Meskipun berada dalam situasi sulit, Shiki menolak untuk mundur. Bekerja sama dengan teman-temannya, Shiki harus menghadapi Dark Alchemist jika ia berharap bisa selamat dari Belial Gore.

Sumber: MAL